根据相关法律法规和党的纪律要求，关于公司是否应该为员工参加入党培训扣工资的问题，综合分析如下：
一、党员培训的性质与义务 党员培训是政治义务而非福利入党培训是党员履行政治义务的一部分，属于党的组织生活内容，与普通员工培训性质不同。
法律与党纪无强制扣款规定我国现行法律和《中国共产党党员教育管理工作条例》均未规定单位有权因参加培训而扣工资。
二、工资扣除的合法性要求 必须有合法依据用人单位若要扣除工资，需基于合法协议（如服务期协议）或员工明确同意，且需提供实际损失证明。
培训不属于法定的可扣情形劳动合同法明确禁止因参加培训直接扣工资，仅允许在员工违反服务期或保密协议时，且需符合法定程序。
三、处理建议 确认培训性质与协议若单位以党员身份要求扣工资，需核实是否签订过相关协议，且协议内容是否合法合规。
与单位协商解决建议员工与人力资源部门或直接上级沟通，明确培训费用承担方式，避免单方面强制扣款。
维权途径若单位无合法依据扣款，可通过以下方式维权：
向劳动监察部门投诉；
申请劳动仲裁或诉讼。
四、特殊情况处理若单位以党员身份要求参加培训且涉及脱产学习，可参考以下处理方式：
审批与协调 ：先向公司领导申请培训审批，若涉及关键岗位或多人培训影响生产，可协调组织部门沟通是否允许部分人员脱产；
保留证据 ：保留培训通知、工资条等证据，为后续维权提供依据。
综上，单位以党员身份要求扣工资的行为通常缺乏法律依据，建议通过协商或法律途径解决争议。
