内部签订的培训协议是否合法，需根据协议性质及内容综合判断，主要分为以下情况：
一、专项培训协议 合法性基础根据《中华人民共和国劳动合同法》第二十二条，用人单位为劳动者提供专项培训费用并对其进行专业技术培训时，可以与其订立服务期协议。此类协议在双方自愿、平等且不违反法律强制性规定的情况下，具有法律效力。
违约金条款的约束性违约金不得超过用人单位提供的培训费用；
违约金不得超过服务期尚未履行部分所应分摊的培训费用。
单位违约的处理若单位未按照协议提供培训或未依法涨薪，劳动者可主张单位违约，此时无需履行服务期约定，单位无权扣除工资。
二、非专项培训协议 一般效力非专项专业进修培训所签订的协议通常不受《劳动合同法》第二十二条的约束，除非双方明确约定服务期。
解除协议的条件劳动者可依据《劳动合同法》第三十八条（如未及时足额支付劳动报酬）或第四十六条（如协商一致）解除协议，无需承担违约责任。
三、其他注意事项劳动合同的优先性 ：若协议内容与劳动合同矛盾，以劳动合同为准。
服务期与工资调整 ：协议约定服务期不影响用人单位依法进行正常工资调整。
证据留存 ：协议、工资条、培训记录等均为重要证据，建议妥善保存。
综上，内部培训协议的合法性需结合培训性质及协议条款判断，建议签订前咨询专业律师以确保权益。
