公司克扣培训补贴是否合法，主要取决于以下几点：
双方是否有明确约定 ：如果公司与员工之间有明确的培训费用约定，并且该约定是双方一致同意的，那么公司可以根据约定扣除培训费用。
如果未签订培训协议或未明确约定费用，公司不能随意扣除员工工资，否则属于违反《中华人民共和国劳动合同法》的行为。
是否在服务期内 ：如果员工接受了公司的专项培训并签订了服务期协议，在服务期内辞职，公司可以根据协议要求员工支付违约金，但违约金的数额不得超过公司提供的培训费用。
如果员工在服务期未满时离职，公司通常不能要求支付违约金，除非有明确的合同约定。
是否在试用期内 ： 公司在试用期三个月内扣除培训工资是违法的，因为用人单位有义务承担正常的培训费用，不能将培训费用转嫁给员工。 扣除金额是否合理 ： 即使有合法依据扣除培训费用，公司每月扣除的部分不得超过员工当月工资的20%，且扣除后的剩余工资部分不得低于当地月最低工资标准。综上所述， 公司在没有明确约定、未在服务期内或试用期内的前提下克扣培训补贴通常是不合法的 。员工可以通过劳动监察部门举报或向劳动仲裁委员会申请仲裁来维护自己的权益。建议公司在进行培训费用扣除时，务必与员工签订明确的培训协议，并确保扣除金额合法合理。
