公司出资为员工提供培训并签订协议的行为在法律上是合法的，但需符合相关法律规定和合同条款的约定。以下是具体分析：
一、合法性基础 法律允许用人单位提供专项培训根据《劳动合同法》第二十二条，用人单位为劳动者提供专项培训费用并约定服务期的，双方签订的培训协议具有法律效力。
服务期条款的合法性劳动者违反服务期约定时，需按约定支付违约金，但违约金数额不得超过用人单位提供的培训费用，且不得高于服务期尚未履行部分所应分摊的培训成本。
二、操作规范要求 协议内容合法性培训协议应明确培训内容、服务期长度、违约金计算方式等条款。
违约金不得超过培训费用与服务期未完成部分的合理分摊额。
工资与培训费用的关系培训期间的工资、津贴、奖金属于劳动者的正常报酬，不计入培训费用。若协议中包含“培训期间工资不计入培训成本”的条款，则可能被认定为无效。
协议形式要求培训协议可作为劳动合同的附加条款，具有法律约束力。
单独签订的培训协议（未与劳动合同关联）通常无效，但可作为协商依据。
三、注意事项避免霸王条款 ：用人单位不得以培训为名强制签订不合理协议，或要求支付过高费用。
工资调整机制 ：服务期约定不影响劳动者享受正常的工资调整权利。
综上，公司出资培训并签订协议的行为本身合法，但需确保协议内容合规、程序合法，并明确双方权利义务。
