公司使用专项培训协议是 合法的 。根据《中华人民共和国劳动合同法》第二十二条的规定，用人单位为劳动者提供专项培训费用，对其进行专业技术培训的，可以与该劳动者订立协议，约定服务期。劳动者违反服务期约定的，应当按照约定向用人单位支付违约金。
具体来说，专项培训协议是一种双方自愿签订的合同，用于明确公司在员工接受专项培训期间及培训后的权利和义务，以及员工在违反服务期约定时应承担的违约责任。这种协议有助于保护公司在培训方面的投资利益，同时也确保了员工在接受培训后能够按照约定履行服务义务。
需要注意的是，虽然专项培训协议是合法的，但违约金的数额不得超过用人单位提供的培训费用，且用人单位要求劳动者支付的违约金不得超过服务期尚未履行部分所应分摊的培训费用。此外，培训费用通常包括用人单位为了对劳动者进行专业技术培训而支付的有凭证的培训费用、培训期间的差旅费用以及因培训产生的用于该劳动者的其他直接费用，而不包括培训期间的工资，因为工资是原本就应当发放的。
综上所述，公司使用专项培训协议是符合法律规定的，但协议内容必须符合法律法规的要求，且双方自愿签订，才能确保其合法有效。
