以下几种苗木的发票不能用于抵扣增值税：
普通发票 ：购买苗木的普通发票不能用于抵扣，因为普通发票不能开具增值税发票，而只有增值税专用发票才能用于抵扣。
不符合规定的发票 ：如果苗木购进时没有资格开具农产品收购发票，也没有取得税务局代开的农产品自产自销的免税发票，或者取得的免税发票未按规定注明“自产自销”，这些情况下苗木的发票也不能用于抵扣。
用于免税项目的发票 ：即使取得了合格的抵扣凭证，但如果苗木的用途属于不得抵扣进项税额的范围，比如用于免税项目，那么这些发票也不能用于抵扣。
简易计税项目的发票 ：用于简易计税项目的苗木免税发票不能抵扣进项税。
非报销类目 ：苗木如果属于发票项下的报销类目之外的用途，也不能进行抵扣。
超过限额的普通发票 ：如果购买苗木的费用超过普通发票的最高限额（如1000元），则不能按照普通发票抵扣，而应凭借增值税专用发票进行抵扣。
综上所述，只有符合特定条件且开具的是增值税专用发票的苗木才能用于抵扣增值税。其他情况下，苗木的发票均不能用于抵扣。建议在实际操作中咨询当地税务机关或专业会计师，以确保符合最新的税收政策和规定。
