可以抵扣的苗木发票主要有以下几种：
免税发票 ：定义 ：免税发票是指销售方为农业生产者，并且销售的产品是自产免税农业产品。
抵扣规则 ：可抵扣额 = 票面金额 × 9%。
3%专票 ：定义 ：从农业生产者手中直接购进苗木时取得的3%税率的增值税专用发票。
抵扣规则 ：不含税金额 = 含税价 ÷ （1 + 3%），可抵扣额 = 不含税金额 × 9%。
9%专票 ：定义 ：从农业生产者手中直接购进苗木时取得的9%税率的增值税专用发票。
抵扣规则 ：直接勾选发票税额进行抵扣。
农产品收购发票 ：定义 ：收购单位向农业生产者个人收购自产免税农业产品时，由付款方向收款方开具的发票。
抵扣规则 ：现在基本上为电子发票，税控设备开具的增值税普通发票，左上角自动打印“收购”字样，可按照农产品销售发票的规定进行抵扣，即按发票上注明的农产品买价和11%的扣除率计算进项税额。
农产品销售发票 ：定义 ：农业生产者销售自产农产品时开具的发票。
抵扣规则 ：纳税人购进农产品，取得农产品销售发票或收购发票的，以农产品销售发票或收购发票上注明的农产品买价和11%的扣除率计算进项税额。
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