在常州开具苗木款发票，您可以选择以下几种方式：
苗圃或合作社自产自销苗木 ：可以到税务局办理税控设备自行领购发票并开具发票。
如果购买方是村委会且没有税号，可以不填写税号。
税务局代开发票 ：如果企业收到征地补偿苗木补偿，可开具增值税普通发票，注明“征地补偿款”等字样，税率为免税。
对于苗木补偿部分，若苗木是企业自行种植销售的，可按销售货物开具发票；若是农户等个人提供的苗木补偿，可由收款方到税务机关代开发票，注明相关补偿内容。
建议您根据具体情况选择合适的方式进行开票，确保信息真实准确，符合税收法规要求。
