苗木发票的抵扣金额主要取决于发票类型和销售方资质。具体来说：
免税发票 ： 如果销售方是农业生产者且开具的是免税发票，普通发票的抵扣比例通常为10%。 3%专票 ： 对于小规模纳税人开具的3%专票，计算方式为不含税金额乘以9%。 9%专票 ： 一般纳税人开具的9%专票，可以直接勾选发票税额进行抵扣。 农产品收购发票或销售发票 ： 如果从农业生产者手中购进苗木，并且取得农产品收购发票或销售发票，通常可以按照9%的税率计算抵扣进项税额。 建议确认销售方资质 ：在计算抵扣进项税额前，需要确认销售方是否为农业生产者，以及是否开具的是符合抵扣条件的发票类型。
选择合适的发票类型 ：作为一般纳税人，应尽量选择开具9%专票，以最大化抵扣进项税额。如果是小规模纳税人，则应选择开具3%专票或1%普票。
注意免税政策 ：自产自销的苗木可以享受免税政策，开具免税发票，但抵扣比例通常为10%。
