苗木的免税普通发票可以抵扣的个人所得税率为 9% 。具体而言，苗木免税普票是指购买苗木、苗木种子和观赏用苗木，以及和苗木有关的初级加工原料，其销售给纳税人的普通发票的税收，可以抵扣9%的税收。
需要注意的是，如果购买的苗木费用超过1000元，则不能按照普通发票抵扣，而应凭借增值税专用发票进行抵扣。此外，商贸企业在购买苗木和种子及其加工原料时，可以抵扣13%的增值税。
因此，无论是个人还是企业，在购买苗木时，如果取得的是免税普通发票，可以按照9%的税率进行个人所得税的抵扣。
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