以下是一些知名的脱毒苹果苗木繁育基地：
博士达有机苹果示范基地 ： 位于山东，拥有400余亩的脱毒苗木基地。 江苏雨露红苹果树苗培育基地 ： 泽雨公司与中国农科院果树研究所合作，繁育新优品种脱毒苹果苗木，基地位于山东，占地5000平方米标准化“苹果母本园”。 中国农科院果树所烟台科技示范基地 ： 拥有脱毒母本树引种发票及中国农科院下发市政府的红头文件，确保苗木品质权威保障。 静宁县苹果良种苗木组培繁育中心 ： 集苹果苗木脱毒快繁、标准化培育、质量检测、信息溯源为一体的繁育中心，年可出圃抗重茬脱毒苗木200万株以上。 烟台栖霞中惠苗木基地 ： 主要繁育中国农科院脱毒苗木，矮化苹果苗木，基地位于栖霞市，占地1000亩。 陕西蔷薇农业科技有限公司 ： 通过组培技术培育脱毒种苗，位于黄陵县，年产苹果脱毒种苗30万株左右。 华圣种苗 ： 陕西华圣现代农业集团全资子公司，拥有全球最大的矮砧苹果苗木繁育基地6000亩，并设有苗木组培脱毒中心。 静宁飞天林果科技有限公司 ： 年产苹果抗重茬双脱毒品种苗50万株，桃、李、杏抗重茬双脱毒品种苗10万株，采用茎尖剥离技术生产双脱毒苗木。 国家级无病毒苗木繁育和栽培试验基地 ： 自1991年被国家农业部批准为国家级基地，进行无病毒苗木的试验研究和用户实践。
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