苗木合格证在 县级森林病虫防治检疫站 办理。具体步骤如下：
提交书面材料 ：申请人需提供货物名称、包装、产地、发货单位、收货单位、起运地点、运往地点、购销合同等基本情况的书面材料。
提供身份证明 ：申请单位需提供法人证书或申请人身份证明复印件。
办理产地检疫合格证 ：县级森林病虫防治检疫站根据提交的材料和实际情况，为苗木办理《产地检疫合格证》。
建议在办理苗木合格证前，先咨询当地县级森林病虫防治检疫站，了解具体的办理流程和所需材料，以确保顺利办理。
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