山东苗木发票的抵扣税额主要取决于销售方资质和发票类型。具体来说：
免税发票 ： 农业生产者自产自销的苗木类发票是免税的，因此不存在抵扣税额的问题。 小规模纳税人开具的发票 ： 小规模纳税人可以开具1%或3%的增值税专用发票或普通发票。可抵扣的进项税额计算公式为：可抵扣额 = 不含税金额 × 9%。 一般纳税人开具的发票 ： 一般纳税人按9%开具增值税专用发票或普通发票，可以直接勾选发票税额进行抵扣。 购进免税苗木的发票 ： 购进免税苗木发票的抵扣进项税额可以按发票上的金额计算抵扣，计算公式为：进项税额 = 农产品收购发票上注明的苗木买价 × 9%。综上所述，无论是销售方还是购买方，山东苗木发票的抵扣税额主要依据发票类型和销售方资质来确定。销售方如果是农业生产者自产自销，则免税；如果是小规模纳税人，则按1%或3%的税率计算抵扣；如果是般纳税人，则按9%的税率计算抵扣。购进免税苗木时，进项税额按发票上的买价乘以9%计算。
