码头厂区装载机的操作证 由多个部门颁发 ，具体包括：
劳动部门或农机部门 ：装载机操作证是特种车辆驾驶证，不能开汽车。该证由劳动部或安监局批准办理，也称为上岗证或IC卡证。
安全生产监督管理局 ：装载机属于特种设备，操作必须持有特种作业操作证，此证在当地的安全生产监督管理局办理。
中国建设机械教育协会（中国建协） ：由中国建设机械教育协会颁发的装载机操作证共一套两个证书，此证书是装载机操作所必备的，并且在上级部门以及政府安全检查时一般都是检查这个证书。
综上所述，码头厂区装载机的操作证可以由劳动部门或农机部门、安全生产监督管理局、中国建设机械教育协会等多个部门颁发。建议根据具体需求和实际情况选择合适的部门进行咨询和办理。
